MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus LGA251 plasmid pLGA251

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017348	ATATT	2	10	42	51	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017348	ATTT	2	8	54	61	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017348	AACAA	2	10	66	75	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017348	AATG	2	8	88	95	50 %	25 %	25 %	0 %	387781659
5	NC_017348	AT	3	6	108	113	50 %	50 %	0 %	0 %	387781659
6	NC_017348	A	6	6	118	123	100 %	0 %	0 %	0 %	387781659
7	NC_017348	TAG	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387781659
8	NC_017348	AAG	2	6	186	191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387781659
9	NC_017348	CAAAA	2	10	200	209	80 %	0 %	0 %	20 %	387781659
10	NC_017348	AACTA	2	10	264	273	60 %	20 %	0 %	20 %	387781659
11	NC_017348	AT	3	6	275	280	50 %	50 %	0 %	0 %	387781659
12	NC_017348	ATT	3	9	287	295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387781659
13	NC_017348	GATATG	2	12	348	359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387781659
14	NC_017348	A	6	6	382	387	100 %	0 %	0 %	0 %	387781659
15	NC_017348	TGG	2	6	436	441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387781659
16	NC_017348	A	7	7	568	574	100 %	0 %	0 %	0 %	387781659
17	NC_017348	ATA	2	6	671	676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017348	TTC	2	6	797	802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017348	TAAA	2	8	863	870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017348	ATTA	2	8	873	880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017348	ATT	2	6	896	901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017348	TTCA	2	8	912	919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017348	TAA	2	6	975	980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017348	T	6	6	1020	1025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017348	TAA	2	6	1095	1100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017348	GAAC	2	8	1138	1145	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017348	AT	3	6	1153	1158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017348	ATC	2	6	1173	1178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017348	AAAT	2	8	1210	1217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017348	AT	3	6	1216	1221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017348	AT	3	6	1528	1533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017348	TACA	2	8	1559	1566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017348	T	6	6	1594	1599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017348	A	6	6	1602	1607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017348	A	6	6	1613	1618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017348	TCA	2	6	1627	1632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017348	ATA	2	6	1645	1650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387781660
38	NC_017348	CTT	2	6	1698	1703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387781660
39	NC_017348	TGT	2	6	1708	1713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387781660
40	NC_017348	TCA	2	6	1721	1726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387781660
41	NC_017348	ATTA	2	8	1732	1739	50 %	50 %	0 %	0 %	387781660
42	NC_017348	CCA	2	6	1796	1801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387781660
43	NC_017348	T	7	7	1859	1865	0 %	100 %	0 %	0 %	387781660
44	NC_017348	A	6	6	1880	1885	100 %	0 %	0 %	0 %	387781660
45	NC_017348	TTC	2	6	2029	2034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387781660
46	NC_017348	TA	3	6	2041	2046	50 %	50 %	0 %	0 %	387781660
47	NC_017348	T	7	7	2053	2059	0 %	100 %	0 %	0 %	387781660
48	NC_017348	TTA	2	6	2123	2128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387781660
49	NC_017348	CAA	2	6	2157	2162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387781660
50	NC_017348	TTAG	2	8	2207	2214	25 %	50 %	25 %	0 %	387781660
51	NC_017348	T	6	6	2255	2260	0 %	100 %	0 %	0 %	387781660
52	NC_017348	CAAC	2	8	2278	2285	50 %	0 %	0 %	50 %	387781660
53	NC_017348	CTT	2	6	2310	2315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387781660
54	NC_017348	TCGG	2	8	2426	2433	0 %	25 %	50 %	25 %	387781660
55	NC_017348	T	6	6	2477	2482	0 %	100 %	0 %	0 %	387781660
56	NC_017348	TTTTC	2	10	2526	2535	0 %	80 %	0 %	20 %	387781660
57	NC_017348	TC	3	6	2534	2539	0 %	50 %	0 %	50 %	387781660
58	NC_017348	GTT	2	6	2547	2552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387781660
59	NC_017348	TAT	2	6	2583	2588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017348	TAG	2	6	2610	2615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017348	TAT	2	6	2616	2621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017348	TAT	2	6	2645	2650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017348	TAA	2	6	2667	2672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017348	T	6	6	2684	2689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017348	AT	5	10	2753	2762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017348	TA	3	6	2779	2784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017348	CAAGA	2	10	2789	2798	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017348	A	8	8	2822	2829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017348	CTT	3	9	2840	2848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017348	TAAA	2	8	2867	2874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017348	AATA	2	8	2893	2900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017348	ATA	2	6	2971	2976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017348	AAT	2	6	2978	2983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.